An der Spitze der Unternehmensgruppe Stoffel steht die STOFFEL Holding GmbH.
Die STOFFEL Holding GmbH ist zu 100% an den übrigen operativen Gesellschaften beteiligt. Den operativen Gesellschaften sind die Projekt- und Objektgesellschaften angegliedert.
Operative Gesellschaften in diesem Sinne sind die STOFFEL Holding GmbH, die STOBAU Nord Bauträger GmbH, die Pro-Projektentwicklungs GmbH, die GSB Betriebs- und Beteiligungs GmbH, die Confidentia Vermögensverwaltungs
GmbH sowie die Immo-Invest Immobilien GmbH.
Die Unternehmensgruppe Stoffel realisiert ihre laufenden Projekte in der Regel in eigenen Projektgesellschaften. Die operativen Gesellschaften dienen den Projektgesellschaften als Dienstleister, vor allem als Bauträger und Projektsteuerer.

Die STOFFEL Holding GmbH koordiniert die gesamten Aktivitäten der Unternehmensgruppe. Die Gesellschaft hält Beteiligungen und stellt dem Konzern ihr unternehmerisches Know How zu Verfügung.
Die STOBAU Nord Bauträger GmbH ist historisch gesehen der Ursprung der Unternehmensgruppe Stoffel. Ursprünglich wurde das gesamte Leistungsspektrum wie Projektentwicklung, Bauträgertätigkeiten und Vertrieb durch die Gesellschaft abgedeckt.
Die Confidentia Vermögensverwaltungs GmbH ist mit der Verwaltung von Vermögensanlagen betraut. Die Gesellschaft ist für die Neuvermietungen zuständig, weiter werden die laufenden Projekte der Unternehmensgruppe Stoffel buchhalterisch betreut.
Die Unternehmensgruppe Stoffel hebt sich von ihren Mitbewerbern entscheidend durch ihre besondere Leistungsfähigkeit im Bereich der Projektentwicklung und –steuerung ab. Diese Kernkompetenz mitsamt dem technischen und projektbezogenen Know How wird von der Pro-Projektentwicklungs GmbH repräsentiert.
Unter dem Dach der GSB Betriebs- und Beteiligungs GmbH sind die Aktivitäten der Unternehmensgruppe Stoffel im Bereich Dienstleistung und Öffentlichkeitsarbeit zusammengefasst. Diese werden selbst bzw. durch Tochtergesellschaften erbracht. Beispielsweise betreibt die GSB Betriebs- und Beteiligungs GmbH das Hotel Theresientor und ist Hauptgesellschafter der Straubing Tigers GmbH.
Die Immo Invest Immobilien GmbH repräsentiert das ehemalige Geschäftsfeld der Unternehmensgruppe Stoffel: Erstellung und Halten von gewerblichen Supermärkten. Aus dieser früheren Tätigkeit ist die Immo Invest Immobilien GmbH an Objektgesellschaften beteiligt.
Die STOFANEL Investment AG ist ein Projektentwicklungsunternehmen, zu jeweils 50 Prozent Eigentum von Giovanna Stefanel-Stoffel und der STOFFEL Holding GmbH, beziehungsweise des Hauptgesellschafters Ludwig Maximilian Stoffel. STOFANEL entwickelt nationale und internationale Wohn- und Gewerbeimmobilienprojekte im High Value Bereich.